En 2004, à la demande de la ville de Nantes, C&B réalise un diagnostic présentant une suite de travaux à réaliser sur cette église du XIXe siècle, qui représente une part importante de l’identité de la ville. Le désordre le plus évident était le risque de chute de la flèche qui n’était plus convenablement maintenue.

Menaçant de s’effondrer, elle a dû être déposée en toute urgence. La charpente du dôme fut ainsi restaurée, tout comme le campanile, la flèche et l’archange, retrouvant alors sa dorure d’origine.